경찰은 정몽규 전 회장과 이임생 전 기술총괄이사, 김정배 전 상근부회장이 위계에 의한 업무방해 혐의가 있다고 판단했다. 경찰 조사 결과, 이들은 홍명보 감독 선임 당시 축구협회 이사회에 허위 내용이 담긴 자료를 제출해 이사회의 업무를 방해한 것으로 드러났다. 해당 자료에는 정해성 전 전력강화위원장이 후임 감독 선임 작업을 요청했다는 내용과 이임생 전 이사가 정당한 권한으로 선임 과정을 진행했다는 취지의 문구가 포함됐으나, 경찰은 실제 그런 요청은 없었던 것으로 파악했다. 이사회 관계자들은 해당 자료가 없었다면 선임 절차가 진행되지 않았을 것이라는 취지로 진술한 것으로 알려졌다. 한편, 감독 선임 과정에 개입했다는 의혹을 받았던 홍명보 전 감독은 증거 불충분으로 무혐의 처분을 받았다. 정 전 회장은 감독 선임이 적법하게 이루어졌으며 이사회를 속인 사실이 없다고 주장하며 검찰 수사를 통해 오해를 해소하겠다는 입장을 밝혔다.